Trafiamy na wyspę One Island. Jest tutaj wiele do roboty, jednak nie będziemy prawie nic robić teraz (później to wszystko wytłumaczę - najpierw przejdźmy właściwą część gry). Przygodę z wyspami rozpoczynamy w wielkim Poke Center, gdzie Bill razem ze swoimi naukowcami pracuje nad innowacyjnym systemem. Nasz stary znajomy daje nam nową mapę poruszania się po wyspach, przepustkę na wyspę trzecią oraz dziwny meteoryt. Teraz istnieją dwie możliwośći: możemy iść na północ i złapać Moltresa (przy okazji zdobyć mnóstwo XP), lub też od razu udać się na Drugą Wyspę i uniknąć walki, kontynuując swoją przygodę. Łapaniem Moltresa i innymi smaczkami zajmiemy się później (jest na to czas). Wracamy do łodzi i wybieramy opcję Two Island).