W Worm Run gracz przejmuje kontrolę nad Zeke Tallahasseem - pracującym w przestrzeni kosmicznej woźnym, który znalazł się w złym miejscu i czasie. Sprzątając kosmos staje się celem krwiożerczego robala - jedynym ratunkiem dla niego jest ucieczka. W niej właśnie gracze będą mieli okazję mu pomóc. Za pomocą przesunięć palca będą zmuszeni omijać wiele przeszkód, podróżując przez pięć unikalnych światów i walcząc o życie.
Gra ma odróżniać się od innych między innymi losowo generowanymi poziomami, dzięki którym każda rozgrywka jest zupełnie innym doświadczeniem. Dodatkowo dzięki integracji z usługą Game Center gracze mają szansę rywalizować z innymi w rankingach punktowych.
