PES 2009 skupia się na realistycznym oddaniu warunków panujących na boisku piłkarskim, gwarantując nie tylko wysoką jakość fizyki w kwestii poruszania się futbolówki, ale również możliwość dokonywania zmian taktycznych, z której korzysta także sztuczna inteligencja. Wielką rolę odgrywa w tym wypadku system Teamvision, znany już z poprzedniej edycji gry. Sprawia on, że komputerowi przeciwnicy powoli uczą się naszego stylu, zdolni są się do niego zaadoptować i wykorzystać nasze słabe strony. W tej odsłonie technologia ta została jeszcze bardziej rozwinięta.
Become a Legend i Legends
To nowe tryby, jakie pojawiły się w serii wraz z edycją 2009. Become a Legend pozwala nam stworzyć własnego piłkarza, a następnie poprowadzić jego karierę od nastolatka po doświadczonego piłkarza. Możemy tutaj zdefiniować wygląd i fizyczne atrybuty, wybrać silniejszą nogę czy preferowaną pozycję oraz styl gry. Rozwinięciem tego pomysłu jest tryb Legends, który pozwala na wspólną zabawę maksymalnie czterech graczy.
Licencje
PES 2009 to także pierwsza odsłona serii, w której pojawiło się słynne logo Ligi Mistrzów, a wraz z nią liczne kluby w niej występujące. Konami nie udało się jednak odwzorować wszystkich z nich, gdyż wiele licencji na wyłączność posiada cykl FIFA. Podobna sytuacja ma miejsce także z piłką klubową. Nie uświadczymy tu angielskiej Premier League w klasycznym wydaniu, gdyż poza Liverpoolem oraz Manchesterem United Konami nie mogło wprowadzić oryginalnych nazw klubów z Wielkiej Brytanii. Jednak w takim przypadku zobaczymy teamy po prostu pod innymi nazwami (nawiązującymi do historii zespołów), za to z właściwymi piłkarzami.


